Это решения для разных задач, общее у них только одно — работа с токенами ЭП. Ключник ГОСТ нужен для ручного подписания сотрудниками. Ключник API — для автоматического подписания из информационных систем, когда объем измеряется тысячами операций в сутки и руками это не решить. Например, автоматические запросы в госорганы система подписывает сама.